纳家户清真大寺是一座传统的中古式建筑寺院。寺院呈长方形，以门楼、礼拜大殿、厢房、沐浴堂组成院落，形成典型的中国古代四合院建造布局。 门楼为过洞式，上面壁部是一组仿古结构的挑檐，横向的栏额、斗拱，纵向的荷花柱和反映伊斯兰风格的精美砖雕，增加了壁面的光泽。上部正中为三层歇山顶邦克楼，楼两侧陪立着阿拉伯式的二层四角圆尖顶的望月楼。整个布局严谨、规整，显示了大寺雄壮气势。