1938年夏,新四军*、第二支队先后挺进苏南敌后,开展抗日游击战争,次年11月,新四军江南指挥部在水西村成立,统一指挥*、第二支队和地方抗日武装,巩固和发展了苏南抗日根据地。新四军江南部队的指挥机构。1939年8月,新四军第二支队司令员张鼎丞已赴延安,新四军军部决定第1、第2支队由陈毅统一指挥,并增设新四军江南指挥部建制,统一领导第1、第2支队。11月7日,新四军江南指挥部在溧阳水西村公开宣布成立,指挥陈毅,副指挥粟裕,参谋长罗忠毅,政治部主任刘炎、副主任钟期光。指挥部辖第2团、新6团、第4团、挺进纵队和地方武装,共1. 4万余人。11月14日,第4团团部及2营组成为苏皖支队,渡江北上,1940年2月与先期过江的挺纵第3团合编,仍称苏皖支队。5月,新四军江南指挥部重新组建第3团、第4团。1940年7月,新四军江南指挥部率第2团、新6团北渡长江进入苏北,改称新四军苏北指挥部。第2支队在司令员罗忠毅、副司令员廖海涛领导下,留下坚持茅山地区的抗日斗争,对外仍以江南指挥部名义活动,并指挥新3团、新4团和各县地方武装,共3000余人,后又组建了独立第1、第2团。1941年1月皖南事变后,第2支队改编为新四军第6师第16旅。