阿尔金山自然保护区位于阿尔金山南部，东昆仑山北部，西起若羌和且末两县分界线，东至新疆与青海两省区交界处，北到阿尔金山南部的祁曼塔格山，南为新疆与西藏分界的东昆仑山脉，东西长360公里，南北宽190公里，总面积为44940平方公里。阿尔金山保护区内，四周高山环绕，其中慕士塔格峰，海拔高达6973米。现代冰川、高原湖泊和高原沙漠与种类繁多的藏野。 驴、藏羚、野牦牛、野骆驼及黑颈鹤、藏雪鸡、白肩雕、玉带海雕等珍禽异兽，连同241种野生植物，蔚为高原奇观。阿尔金山的河、湖、泉阿尔金山保护区内主要有8条河流组成了高原盆地中的“大动脉”，滋润着广阔的高山草场。8条主要河流的的流域面积达两万平方公里。河流的水量补给主要的两种即冰川融水和出露泉水。保护区内河流形态各异，直泻湖盆；有的时而潜入地下，时而冒出地面，缓缓向盆地洼地汇集；有的水质纯洁；有的矿化度高达71.5克/升。苏鲁贝提勒克河为保护区的河流，原于新青峰北坡，注入阿牙克库木湖，全长280公里，流域面积达6250平方公里。 保护区湖泊星罗棋布，总面积1200平里，占保护区面积的2.7%，对调节区内气候起着重要作用。阿牙克库木湖位于保护区北部，面积536平方公里；阿其克库勒湖位于保护区西部，面积352平方公里，矿化度81.6克/升，湖中屹立着两个小岛，远远望去，犹如劈波斩浪前进的舰艇。岛上居住着大量的鸟群。鲸鱼湖位于保护区南部，以形似鲸鱼湖而