小丑鱼主题馆(前国立台东海洋生物展览馆)隶属于行政院农业委员会水产试验所东部海洋生物研究中心，主要展览小丑鱼生态及种类，是国内较大的小丑鱼主题展览馆。水产试验所东部海洋生物研究中心于2002年开始利用人工繁殖复育方式，成功复育了许多不同种类的小丑鱼，馆内并放映小丑鱼生态介绍影片，活泼有趣，游客可以来此近距离欣赏电影「海底总动员」中主角「尼莫」可爱的模样。 小丑鱼主题馆(前国立台东海洋生物展览馆)的展示馆分成东展示馆、西展示馆，有沿岸礁岩淡水鱼类、五彩缤纷的珊瑚礁鱼类、章鱼、海胆、水母及贝类、贯穿三层楼的大圆柱缸，呈现台湾东部迴游性生物的大洋池，展示丰富又奇特的海底生物。此外，馆内还设有触摸池，家长可以带小朋友亲自来体验触摸，非常具有教育义意。