六库镇地处怒江州州府所在地，地跨高黎贡山东麓至碧罗雪山西麓的两岸，它东与老窝乡相邻，西与缅甸接壤，北接鲁掌镇，南至上江乡。全镇总面积375.94平方公里，境内山高谷深、沟壑纵横，其高处海拔为3100米，低处海拔800米。 年平均降雨量1115毫米，年平均气温19℃，属典型的亚热带山地立体气候，山势总体呈“凹”字型，东西高，中间低，形成高山寒冷，半山温凉，沿江地带炎热，全镇森林覆盖率为56%。