1891年5月教会和当地百姓发生冲突，教堂被烧毁，后由清政府与上海法国领事馆协议用十三万两白银在原址芜湖天主教堂重建。文革期间再次受到破坏，1983年重修。天主教堂平面呈拉丁“十”字形，建筑式样为罗马风格，正面左右两座钟楼高约18米，钟楼之间便是教堂的顶端了，上面竖立着耶酥圣像，直立的身躯和平伸的双臂交叉成高约5米的“十”字，寓意为救赎，通体白色寓意圣洁。教堂从东朝西，采用长十字形平面，面宽17米，宽处27米，东西长达39米，塔楼至高处为29米。半圆形拱券结构是其建筑构图的基本要素。在直廊和横廊的交汇处设有三个祭台，正中是耶酥养父圣约瑟，左侧是圣母玛丽亚，右侧是圣子耶酥，墙面绘有“圣经”彩色故事。 1847年，天主教耶稣会重新来华后，在1847选中徐家汇建立天主教江南传教区的总部，陆续在此建成包括主教府，大、小男修道院，2所女修道院（拯亡会和圣衣会），徐家汇藏书楼，气象台，徐汇公学（后名徐汇中学，男子中学），启明女中，育婴堂等等一系列机构，以此为基地，将教务开展到江苏、安徽2省。其中安徽省主教廷就设在现今的芜湖天主教堂。芜湖天主教堂的规模在华东地区仅次于上海徐家汇天主教堂，统领当时整个江南教区。