吉林水师营博物馆是吉林市2012年文化旅游产业重点推进项目之一，旨在专题展示吉林水师营历史和古船厂文化。历时近6个月，斥资千万元，建成建筑面积1000平方米的吉林水师营博物馆。吉林水师营博物馆的展厅分为两层，馆内陈列由吉林水师营的兴起、吉林古城的兴建、康熙东巡检阅吉林水师营、吉林水师营与雅克萨之战、乾隆东巡吉林、吉林水师营结束历史使命6部分组成。通过实物、图片、景观复原、雕塑等手段，直观地展示了吉林水师营的兴衰历史。为了体现时代感，吉林水师营博物馆还将整段历史制成了一部时长约15分钟的大型专题片《江城从船营起航》。