福建厦门海洋珍稀物种自然保护区位于福建省厦门市海域，总面积33088公顷。该保护区由原有的厦门中华白海豚省级保护区、厦门大屿白鹭省级保护区和厦门文昌鱼市级保护区合并而成。 福建厦门海洋珍稀物种自然保护区保护12种珍稀物种及其生境。是一个以中华白海豚、文昌鱼等珍稀海洋生物及黄嘴白鹭等鸟类为主要保护对象的自然保护区。