邵武清真寺古地约3000平方米，建筑结构属于清代工艺，大殿部分八角花卉柱础具有明代雕刻风格，现存的庭院布局类似中国四合院。入寺门后通过约20米的甬道，正中耸立一座木构宜礼塔，塔上望月楼为三层挑檐塔式小楼阁，上层为八角攒尖顶小亭。大殿木构屋盖作卷棚式，殿内两侧山墙有圆洞窗和圆拱窗。 邵武清真寺被列为市级文物保护单位，邵武市伊斯兰教协会、邵武市回民协会均设于此。寺内珍藏有元代硕石一块，明代铜制香炉一个，木刻版《古兰经》30本。