百年鼓浪屿博物馆以鼓浪屿的近代文化为主题，从鼓浪屿上发现宋代的钱币说起，把整个鼓浪屿带入租界史。全馆又分为20个小馆，包括领事馆区、会审公堂、工部局、教会、学校、洋行、鼓浪屿的商业、洋人居住、器具、鼓浪屿的名人馆等，每个馆内均陈列了丰富的相关历史文物。此外还复原了七八个当年的历史场景。