中游河谷保护区属野生动物类型自然保护区，主要保护对象是国家一级保护动物—黑颈鹤及其越冬栖息地。本区有着较为完整的湿地生态系统，是黑颈鹤越冬的必要条件，因而具有极为重要的保护价值，同时，对于保护区区域内农耕等生存系统的调节和影响，也是湿地生态系统重要的价值所在。